KISTは生徒の学力の発達に注力していますが、G1以上の生徒が運動や芸術活動に参加し、バランスの取れた学校生活を楽しみ、新しい趣味や興味をみつけられるよう、幅広い課外活動の機会も提供しています。
様々な文化、スポーツ、学習関連のクラブが火曜・水・金曜日の放課後にセメスター単位で提供されています。エレメンタリー生（G1以上）のクラブ活動は午後3：30に始まり、4：30に終了します。この時間に帰宅する生徒はスクールバスを利用することもできます。セカンダリー生のクラブは午後3：50に始まり、クラブによって5：00、5：30あるいは6：00に終了します。この時間帯に帰宅するセカンダリー生はスクールバスを利用することはできません。
提供されるクラブ活動の内容は生徒が幅広い経験をすることができるよう、セメスター、あるいは学年度毎に異なります。また、教員の特技やスキルによって提供されるクラブが異なる場合もあります。生徒主導のクラブも教員による監督が必要です。特定のセメスターにコミュニティメンバーまたは外部団体が主催するクラブ活動が月曜あるいは木曜の放課後に提供される場合があります。
近年提供されたクラブには以下のようなものがあります。
文化系クラブ
| 図工 | ピクセルアート | ダンス |
| 折り紙 | チェス | 紙飛行制作 |
| 絵画 | ロックバンド | 写真 |
| ピアノ | フォーク音楽 | ウェブデザイン |
| 料理 | 日本文化 | グリー |
| オーケストラ | ウールクラフト | 和太鼓 |
| イヤーブック | 浴衣縫製 | ボードゲーム |
| 合唱 | ビデオ制作 | レゴロボティクス |
| 電子音楽 | 演劇 | ミュージカル |
| 音楽史 | 競技カルタ | |
| ヨガ | ビーズ |
体育系クラブとチーム
| サッカー | フットサル | オリンピック |
| バスケットボール | ホッケー | 縄跳び |
| バレーボール | ドッジボール | フリスビー |
| 野球 | 卓球 | クリケット |
| クロスカントリー | バドミントン | |
| 武術 | ネットボール |
KISTはインターナショナルスクール東京体育協会（ISTAA）及び関東セカンダリースクール校長会（KPASSP）の会員であるため、セカンダリー生徒は一般的な体育系クラブに加え、シーズン毎に都内近郊の他校との試合に参加することができる運動部に参加することができます。KISTの公式運動部は”The Comets”として知られ、現在以下が活動しています。”Go Comets, Go!”
| バドミントン | 野球 | バスケットボール |
| クロスカントリー | フットサル | サッカー |
| テニス | バレーボール |
学習系クラブ
| 歴史探偵 | 世界の言語 | 模擬国連 |
| サクラメダル | 物語 | Math Field Day |
| 応用物理 | 日本語サポート | 宿題サポート |
| ワールドスカラーズカップ | 数学ヘルプ | Word nerds |
| 創作 | Think Quest | コーディング |
| 討論 | Brain Bowl |
エレメンタリーの生徒たちの宿題をサポートするための「宿題サポートクラブ」がセカンダリー生によって提供されることもあります。
上記一般的なクラブ活動には無料で参加できます。他校との試合を含む運動部（チームスポーツ）への参加にはリーグ戦参加費用をまかなうための費用を徴収される場合があります。
